| dc.description.abstract | Inflammatoire darmziekten, ook wel als IBD aangeduid, is een groep chronische ontstekingsziekten van het maag-darmstelsel. De twee belangrijkste vormen van IBD zijn colitis ulcerosa en de ziekte van Crohn en wereldwijd worden er miljoenen mensen aangetast door deze ziektes. De echte primaire oorzaken van IBD zijn nog onbekend en er wordt hier veel onderzoek naar gedaan. Het lastige aan het onderzoek naar IBD ligt hem in de veelzijdigheid en interconnectiviteit in de pathologie van IBD. Er zijn namelijk een enorme hoeveelheid factoren die mogelijk gerelateerd zijn met het begin en verloop van inflammatoire darmziekten en veel van die factoren beïnvloeden elkaar weer. Daarnaast is het onbekend of deze factoren oorzaak of juist gevolg zijn. Hierbij gaat het om omgevingsfactoren zoals dieet, stress, levensstijl (roken), slaappatronen en (darm)infecties maar ook om genetische factoren. De ontstekingsreacties die de ziektes typeren komen door het aanvallen van eigen afweercellen, en een sterk geactiveerd immuunsysteem is dan ook een kenmerk van chronische darmontstekingen. Waarschijnlijk speelt de darmflora, ook wel darm-microbioom genoemd, een grote rol hierin, dit is de totaliteit aan micro-organismen die zich in het maag-darmstelsel bevinden. Een afwijking van soortenrijkdom van de darmflora (dysbiose) is karakteristiek voor IBD-patiënten en correleert dus ook sterk met de ziekte.
In het onderzoek naar IBD en de mogelijke relatie met de darmflora zijn er de afgelopen decennia veel ontwikkelingen geweest. Door vooruitgangen in technologie zoals moderne DNA-sequencing technologieën is het mogelijk geworden om op andere, diepgaandere manieren de samenstelling van de darmflora te bepalen. Wetenschappelijke velden die veel toegepast worden zijn de zogenaamde omics-methoden. De meest gebruikte hiervan zijn metagenomics, metatranscriptomics, metataxonomics en metabolomics, waarbij respectievelijk gekeken wordt naar de aanwezige bacteriële genen en genomen en RNA van de darmflora, naar de taxonomie van de soorten bacteriën en naar de bacteriële stofwisselingsproducten (metabolieten) welke in de feces of fecale wateren voorkomen. Het is van belang om kritisch te kijken naar hoe de ontwikkelingen binnen deze velden verlopen en om te bedenken welke methodes hierbinnen het meest veelbelovend zijn. Dit verslag zal kijken naar een aantal van de omics velden en de methodes die ze bevatten in een historisch perspectief plaatsen. Deze methodes zullen afgewogen worden op basis van hun voor- en nadelen en er zal gekeken worden naar de richting die het IBD-onderzoek opgaat. Uiteindelijk zullen er aanbevelingen gegeven worden en wordt er gereflecteerd over of er nog aspecten missen in het hedendaagse onderzoek naar inflammatoire darmziekten. | |
