Show simple item record

dc.rights.licenseCC-BY-NC-ND
dc.contributor.advisorMolenaar, Jan
dc.contributor.authorOosterhout, Romy van
dc.date.accessioned2022-06-10T00:00:39Z
dc.date.available2022-06-10T00:00:39Z
dc.date.issued2022
dc.identifier.urihttps://studenttheses.uu.nl/handle/20.500.12932/41624
dc.description.abstractNeuroblastoom is een tumor die waarschijnlijk ontstaat vanuit voorloper cellen van het sympathische zenuwstelsel. Jaarlijks krijgen ongeveer 30 kinderen in Nederland de diagnose neuroblastoom, waarbij de meeste kinderen jonger zijn dan zes jaar. De tumor komt voornamelijk voor in de bijnieren, maar kan ook ontstaan in de buik, borstholte, hals of het bekken. Bij de diagnose wordt aan de hand van het genetische profiel, de plaats en eventuele uitzaaiingen de risico groep bepaald. Patiënten die in de lage- en gemiddelde risicogroep vallen hebben een overlevingskans van ongeveer 90 tot 100%, terwijl patiënten in de hoge risicogroep een overlevingskans van minder dan 50% laten zien, ondanks intensieve therapie. Een afwijking in het ATRX-gen is een indicatie voor het plaatsen van de patiënt in de hoge risicogroep. De meeste van deze afwijkingen betreffen deleties van hele exonen. Het ATRX eiwit is onder andere betrokken bij het reguleren van genexpressie en stabiliteit van DNA doordat het de structuur van chromatine kan veranderen. Tevens wordt er in studies voorgesteld dat het ATRX eiwit ook een rol speelt in het oplossen van secundaire DNA structuren genaamd G-quadruplexen (G4) om replicatie stress te voorkomen. Deze structuren zijn rijk aan guanine en hebben de neiging om het DNA replicatie proces te onderbreken waarbij DNA schade ontstaat. Wanneer er in kankercellen ATRX mutaties optreden worden er meer G4 complexen teruggevonden, wat leidt tot meer DNA schade in deze cellen. Op dit moment zijn er beperkte therapieën beschikbaar voor neuroblastoom patiënten met een ATRX-afwijking. In de afgelopen jaren zijn er een aantal nieuwe therapie opties gevonden voor deze specifieke groep, maar deze therapieën bleken niet erg effectief te zijn in ons lab. Hierdoor is het doel van dit project om specifieke en efficiënte compounds te identificeren voor de behandeling van ATRX neuroblastoom patiënten. In het verleden zijn modellen van de meest voorkomende ATRX deleties in patiënten nagemaakt in neuroblastoom cellen, zodat de gevoeligheid voor compounds vergeleken kan worden met neuroblastoom cellen die geen ATRX-deletie hebben. In deze studie hebben we eerst 199 compounds getest op neuroblastoom cellen met en zonder een ATRX-afwijking. Hierin vonden we vijf compounds die een resistentie lieten zien in ATRX modellen tegenover cellen met een normale ATRX status. Twee van deze compounds worden momenteel ook in de kliniek gebruikt voor de behandeling van neuroblastoom. Echter waren we opzoek naar compounds die juist gevoeliger werden in ATRX modellen. Nadat we geen specifieke compound voor ATRX konden identificeren, hebben we 12 compounds geselecteerd die aangrijpen op mechanismen waarvan bekend is dat ze veranderd zijn in neuroblastoom cellen met een ATRX-afwijking. Helaas vonden we ook hier geen specifieke compound voor ATRX, maar konden we wel drie compounds identificeren die effectief waren in alle geteste neuroblastoom cellen. Het combineren van compounds is gebruikelijk in de behandeling van kanker, waardoor we twee compounds hebben getest in combinatie met ruim 200 compounds. Echter bleek dit niet genoeg voor een krachtige combinatie. Hieruit kunnen we concluderen dat we in deze studie drie compounds hebben gevonden die mogelijk interessant zijn voor de behandeling van neuroblastoom.
dc.description.sponsorshipUtrecht University
dc.language.isoEN
dc.subjectIdentificatie van nieuwe compounds voor de behandeling van patiënten met een hoog-risico neuroblastoom met een afwijking in het ATRX gen.
dc.titleIdentification of effective compounds in ATRX aberrant neuroblastoma cell lines
dc.type.contentMaster Thesis
dc.rights.accessrightsOpen Access
dc.subject.keywordsNeuroblastoma; High-risk neuroblastoma ATRX; G-quadruplexes; Drug screens; High-throughput drug screen; Compounds; RNA polymerase I
dc.subject.courseuuDrug Innovation
dc.thesis.id4357


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record